根据自然出版集团最新发布的自然指数(Nature Index)，中国科研机构对全球科学的贡献近年来显著增加，这种增加不仅是体现在数量上，而且体现在质量上。目前，中国在国际上发表的高质量科学论文数位居世界第三，仅次于美国和欧盟，占全球14%以上。而在20世纪80年代，这一比例不足1%。

　　按照自然出版集团创立的加权分值计数法(以下简称WFC)指数计算，中国科学院2013年发表的高质量科学论文总分为1209.46分，在全球科研机构中名列第一。这一得分比排在第二名的美国哈佛大学高357.34分，比德国马普学会高480.82分，比法国科研中心高488.84分。具体学科方面，在化学、物理学、地球和环境科学领域，中科院位居榜首；在生命科学领域，中科院位居第4位，排在哈佛大学、美国国立卫生院和斯坦福大学之后，但在法国科研中心和德国马普学会之前。

　　据介绍，WFC是自然出版集团邀请国际一流科学家创立，该指数方法根据每篇科学论文的作者数N，将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而非都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，故能在一定程度上反映作者、机构和国家对世界科学的贡献率。

　　此外，根据自然发布的自然指数，东亚及南亚国家的传统强项为物理学和化学，如按照WFC计量，中国90%的科研产出都来自于这两个学科。北美地区有45%来自生命科学领域。南半球地区更专注于地球科学与环境科学。

　　自然指数的数据库追踪了约6万篇优质科研论文的作者单位信息，涵盖全球两万多家科研机构。纳入自然指数的论文取自68种自然科学类期刊，这些期刊由在职科学家所组成的两个独立评选小组选出，自然出版集团估计这68种期刊约占自然科学期刊总引用量的30%。